Study of the distribution of lineages of Mycobacterium tuberculosis in a prison in Guayaquil, Ecuador
Estudio de la distribución de linajes de Mycobacterium tuberculosis en una cárcel de Guayaquil, Ecuador
Esteban Garcés1, Lizeth Cifuentes2, Greta Franco3, Natalia Romero-Sandoval2,4, Patricia Jiménez Arias1,4
1Grupo de Investigación en Sanidad Animal y Humana (GISAH). Departamento de Ciencias de la Vida y de la Agricultura. Universidad de las Fuerzas Armadas ESPE. Sangolquí. Pichincha. Ecuador.
2School of Medicine. Universidad Internacional del Ecuador. Quito. Ecuador.
3Instituto de Investigaciones Leopoldo Izquieta Perez. Guayaquil. Ecuador.
4GRAAL- Ecuador Research Network.
Natalia Romero-Sandoval
E-mail: nromero@uide.edu.ec
RESUMEN
Los linajes de la tuberculosis, una enfermedad infectocontagiosa altamente prevalente en Ecuador no ha sido determinada. El propósito de este estudio es establecer los linajes prevalentes en la cárcel de hombres de la ciudad de Guayaquil, Ecuador. Se analizaron 36 aislados clínicos obtenidos de personas privadas de libertad del Centro de Rehabilitación Social Varones No. 1 de Guayaquil durante el 2016. Los aislados clínicos pertenecen a la colección del Laboratorio de Referencia de Micobacterias del Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública e Investigación (INSPI) de Guayaquil. Los genotipos para cada aislado se determinaron mediante MIRU-VNTR (15 loci), realizando PCR individuales. La prevalencia más alta 97,2% (35/36) corresponde al linaje 4 euroamericano integrado por los sub-linajes: LAM (58,2%), Haarlem (16,7%), Ghana (16,7%) y S (5,6%); mientras que el linaje 2 East Asian representó el 2,8% (1/36) correspondiente al sub-linaje Beijing. Se observa una alta prevalencia del linaje 4 euroamericano principalmente el sub-linaje LAM con presencia de MDR-TB. Al ser un ambiente de confinamiento es vital mejorar las estrategias de diagnóstico, tratamiento y vigilancia epidemiológica junto con genotípica.
ABSTRACT
The lineages of Mycobacterium tuberculosis, the causative agent of tuberculosis, a highly contagious infectious disease in Ecuador, have not been determined in prison conditions. Therefore, the purpose of this study is to establish for the first time the lineages prevalent in a prison population in Guayaquil, Ecuador. 36 clinical isolates obtained from Persons Deprived of Liberty (PDL) at the Male Social Rehabilitation Center No. 1 in Guayaquil during 2016 were analyzed. The clinical isolates belong to the collection of the Mycobacteria Reference Laboratory of the National Institute of Public Health Research (INSPI) of Guayaquil. The genotypes for each isolate were determined by MIRU-VNTR (15 loci), performing individual PCR. The highest prevalence 97.2% (35/36) corresponds to the Euro-American lineage 4 made up of sub-lineages: LAM (58.2%), Haarlem (16.7%), Ghana (16.7%) and S (5.6%); while the 2 East Asian lineages represented 2.8% (1/36) corresponding to the Beijing sub-lineage. A high prevalence of the Euro-American lineage 4 is observed, mainly the LAM sub-lineage with the presence of MDR-TB. Being a confinement environment, it is vital to improve the diagnosis, treatment, and epidemiological surveillance strategies along with genotypic ones.
